Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2aP35436 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2aP35436 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms