Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpardP35396 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpardP35396 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpardP35396 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpardP35396 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpardP35396 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpardP35396 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpardP35396 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpardP35396 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpardP35396 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpardP35396 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpardP35396 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpardP35396 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpardP35396 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms