Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nedd1P33215 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms