Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RxraP28700 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RxraP28700 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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