Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vav1P27870 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms