Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CftrP26361 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CftrP26361 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CftrP26361 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CftrP26361 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms