Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk11bP24788 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk11bP24788 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk11bP24788 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk11bP24788 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk11bP24788 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms