Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms