Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3aP23116 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms