Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TP20293 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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