Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms