Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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