Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms