Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms