Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms