Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms