Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms