Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms