Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P06330 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06330 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06330 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06330 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06330 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06330 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms