Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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