Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms