Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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