Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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BckdkO55028 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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BckdkO55028 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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