Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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