Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DffaO54786 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DffaO54786 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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DffaO54786 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffaO54786 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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