Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek2O35942 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek2O35942 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms