Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms