Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Clk2O35491 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk2O35491 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Clk2O35491 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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