Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms