Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pld3O35405 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pld3O35405 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pld3O35405 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pld3O35405 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pld3O35405 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pld3O35405 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pld3O35405 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pld3O35405 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pld3O35405 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms