Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ltbp2O08999 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ltbp2O08999 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ltbp2O08999 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ltbp2O08999 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ltbp2O08999 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ltbp2O08999 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ltbp2O08999 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ltbp2O08999 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ltbp2O08999 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ltbp2O08999 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ltbp2O08999 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ltbp2O08999 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ltbp2O08999 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ltbp2O08999 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ltbp2O08999 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ltbp2O08999 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Ltbp2O08999 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ltbp2O08999 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ltbp2O08999 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ltbp2O08999 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
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Ltbp2O08999 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ltbp2O08999 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ltbp2O08999 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ltbp2O08999 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ltbp2O08999 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ltbp2O08999 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ltbp2O08999 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ltbp2O08999 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ltbp2O08999 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ltbp2O08999 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms