Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hps1O08983 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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