Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms