Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms