Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms