Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm20795J3QP49 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm20795J3QP49 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gm20795J3QP49 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20795J3QP49 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20795J3QP49 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20795J3QP49 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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