Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Top6blJ3QMY9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms