Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm11236J3QMS7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm11236J3QMS7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm11236J3QMS7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm11236J3QMS7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm11236J3QMS7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm11236J3QMS7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm11236J3QMS7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm11236J3QMS7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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