Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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