Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zfp408H7BX78 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp408H7BX78 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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