Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms