Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms