Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Crocc2F6XLV1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crocc2F6XLV1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms