Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms