Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm9887F6RFI0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm9887F6RFI0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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