Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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R3hdm1E9Q9Q2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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R3hdm1E9Q9Q2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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