Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rdh16f1E9Q9P8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rdh16f1E9Q9P8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rdh16f1E9Q9P8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rdh16f1E9Q9P8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rdh16f1E9Q9P8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rdh16f1E9Q9P8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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