Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms