Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms