Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Clip3B9EHT4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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